中药学：

国内一流学科，拥有“国家中药材产业技术体系皖西综合试验站”、“安徽省博士后科研工作站”、 “安徽省石斛产业化开发协同创新中心”、“中药资源保护与持续利用工程实验室”等国家级、省级创新平台，构建了安徽省高校领军人才团队、石斛产业化关键技术研发与研究创新团队、大别山特色中药资源保护与利用团队，以大别山林下中药材霍山石斛、太子参、白及、灵芝、茯苓等为研究对象，开展其中药资源与分子生物学研究、中药药效及其物质基础研究、中药质量评价与可控性研究，取得省级科技成果鉴定19项、霍山石斛新品种2个，太子参新品种2个，盐肤木新品种5个，制定国家林业行业标准3项、团体标准1项，安徽省地方标准13项；荣获国家科技进步二等奖、中国产学研合作创新成果一等奖、中国商业联合会科学技术奖特等奖、中国商业联合会科技一等奖、中医药国际贡献奖、中国标准创新贡献奖、梁希林业科技进步三等奖、安徽省科技进步二等奖、江苏省科学技术二等奖、安徽省科技进步三等奖、安徽省创新争先奖、六安市突出贡献奖、六安市科技进步一等奖、六安市科技进步二等奖等一系列奖项。

生物工程：

校重点学科，拥有“植物细胞工程安徽省工程技术研究中心”、“安徽省农林废弃物综合利用工程技术研究中心”、“安徽省植物生物技术虚拟仿真实训中心”、“安徽省植物生物技术实训中心”、“六安市蛋白质分析检测中心”以及“啤酒发酵实训中心”等各级各类科研与创新实践平台，建成“生物工程综合实验教学团队”，以发酵工程及酶制剂为研究对象，开展微生物发酵工程及试剂盒产生技术研究，取得省级科技成果鉴定12项、发明专利16项，获得安徽省教学成果一等奖1项，三等奖2项。